房地产开发公司甲与施工单位乙签订了两幢高层住宅的施工合同,其中规定采用在招标文件中即已规定的阶段性付款方式,即基础工程完成后支付相应工程款的80%,结构封顶后,支付相应工程款的90%,其余工程款在竣工结算时结清。房地产开发公司甲委托监理公司A对该两幢高层住宅进行施工阶段全方位监理。
在上部结构施工过程中,发生了如下事件:
(1)根据建设部关于套面积90m2的房型不得少于70%的新规定,房地产开发公司甲要求设计单位相应修改设计,且经有关各方一致同意;
(2)因甲供钢材未能按合同规定的时间运到现场,致使乙整个工程停工待料2周,乙就此提出工期索赔和费用索赔,并经监理工程师审核批准,亦得到甲的同意;
(3)由于该工程所在市政府出台新的规定,禁止夜间施工和节假日施工,造成该工程延期。
[问题]
该工程采用的阶段性付款方式施工合同是否有效?说明理由。乙方应注意什么问题?